Гіперчутливість до діючих речовин або до будь-якого компонента вакцини, включаючи тяжкі алергічні реакції до дріжджів. Особам, у яких розвиваються симптоми, які свідчать про гіперчутливість після введення дози препарату Гардасил, введення наступної дози вакцини протипоказано. Як і щодо інших вакцин, застосування вакцини Гардасил потрібно відкласти у разі наявності у пацієнта гострого захворювання, що супроводжується лихоманкою. Наявність легкої інфекції, такої як незначна інфекція верхніх дихальних шляхів або субфебрильної температури, не є протипоказанням для вакцинації.

Біль, припухлість, почервоніння у місці ін’єкції.
Підвищення температури тіла.
Ломота в м’язах, суглобах.
Озноб.
Втома, сонливість.
Тяжкі ускладнення зустрічаються вкрай рідко (анафілактичні реакції, бронхоспазм, кропив’янка, судоми).